Thomas Wächter wurde 1968 in Lampertheim geboren. Ersten Orgelunterricht erhielt er bei Dirk Schönberger in Lampertheim. Nach Abitur und Zivildienst studierte er an der Robert-Schumann-Hochschule in Düsseldorf Ev. Kirchenmusik, u.a. Chor- und Orchesterleitung bei Prof. Volker Hempfling, Orgel bei Christoph Schoener, Klavier und Improvisation bei Michael Zieschang. Von 1992 – 1995 arbeitete er bei der Ev. Kirchengemeinde Kaarst-Holzbüttgen als nebenamtlicher Kirchenmusiker.
Abschluss im Februar 1995 mit dem B-Examen. 1997 schloss er ein Aufbaustudium im Fach Orgel ab.
Seit 1995 ist er im Ev. Dekanat Rheingau-Taunus mit Sitz in Taunusstein als Dekanatskantor beschäftigt. Schwerpunkt seiner Arbeit ist die Chorarbeit. Er leitet klassische Chöre und ist im Bereich Pop- und Gospelchor als Dirigent und Arrangeur tätig.
Als Instrumentalist ist er nicht nur an der Orgel aktiv: er spielt Tasteninstrumenten aller Art und kann sich für Folkmusik von Irland bis Israel begeistern. Seit 2019 ist er Mitglied im „Interreligiösen Trio“ der „Queen of Klezmer“ Irith Gabriely.